肛门内尖锐湿疣最常见的典型症状就是肛门的边缘以及外阴部可以看见菜花状、鸡冠状或者巨大的团块型湿疣，发病部位在肛管黏膜和皮肤的交界处，肛门边缘以及外阴部都可以发病。初起的时候是微小淡红色或者暗红色、污灰色乳头状隆起，表面常常呈颗粒状或者粗糙不平，形如帽针头或者花蕊状，逐渐增多、增厚，最后变成菜花状、鸡冠状或者巨大的团块，根部常常有蒂。如果继发感染或者疣体内供血不足，会导致脱落、糜烂、溃疡的形成。很多患者会出现局部的瘙痒，夜间会加重，会有压迫感以及轻度刺痛。如果发生于肛管内还会出现里急后重的感觉或者便血，表面如果出现溃烂还会带有恶臭味。