根管治疗1年后，咬合痛的原因包括：1.根尖孔的封闭功能发生破坏，逐渐开放。外界细菌逆行性侵入牙齿内部，不断增生产生大量炎性物质导致胀痛。2.在根管预备过程中，切割了大量牙本质，薄弱的根管侧壁发生穿孔，未能及时修补。牙槽窝内的细菌会沿侧支根管侵入后，引发感染。3.在根管内粘固金属桩核后，形成应力集中，导致牙根隐裂或折裂，牙齿明显移位不敢咀嚼。4.摘除牙髓后，牙体组织比较酥脆，啃咬硬物会使牙冠发生隐裂。裂纹逐渐延伸到牙根部，造成牙齿松动和咬合疼痛，只能拔除患牙。