婴儿吃维生素D3的最佳时间，具体如下：1、维生素D3是脂溶性维生素，所以吃含有脂肪含量比较高的食物，有助于维生素D3的吸收，最好在吃奶以后给宝宝吃维生素D3，有助于维生素D3的吸收；2、婴儿在吃维生素D3时，最好在早餐以后服用，早餐以后服用有助于吸收，有助于维生素D3发挥作用，能够促进钙、磷的吸收和利用；3、必要时宝宝吃维生素D3需要补充钙剂，建议在晚餐以后服用，钙剂有营养神经的作用，晚上睡前吃钙有助于宝宝睡得安眠，防止出现易惊、多汗等钙剂缺乏的症状。所以宝宝吃维生素D3最好在早餐以后服用，钙剂最好在晚餐之后服用。