军人婚外情可以由夫妻双方协商处理，如果军人的配偶想要离婚，但是出轨的军人不想离婚，那么可以采取起诉的方式来结束婚姻关系。这是由于军人婚外情属于有重大过错的情形，不受需要军人同意才能离婚的限制。