阴茎根部瘢痕疙瘩，首先要考虑因素可能是局部的皮肤感染，皮肤肿胀或者是毛囊炎。比如是由于不注意卫生或者是摩擦，导致局部皮肤感染、肿胀，进而形成疙瘩。可以通过局部抗炎治疗。其次应该考虑是皮脂腺囊肿，病毒感染引起的生殖器疱疹，这些情况需要到医院皮肤科进行对症治疗。