血尿大多是由泌尿系统疾病引起，也有一些血尿是由全身性疾病或泌尿系统邻近器官病变所引起。引起血尿常见的泌尿系统疾病有泌尿系感染、结石、肿瘤、畸形、肾小球疾病、多囊肾、肾血管疾病和肾乳头坏死等；引起血尿的泌尿系统邻近器官疾病如急性阑尾炎、盆腔炎、输卵管炎、或邻近器官肿瘤等刺激或侵犯到膀胱、输尿管时，也会引起血尿；引起血尿的全身性疾病有血液病(如血小板减少性紫癜、白血病、凝血因子缺乏、使用抗凝剂治疗)，感染性疾病(如感染性心内膜炎、败血症、流行性出血热)，血管疾病和内分泌代谢疾病等。另外，一些人运动量突然增加也会出现运动性血尿。