阴茎痛和肾结石有关系的，因为肾结石如果结石下移到尿道，就会引起阴茎疼痛，建议你先增加喝水量促进排尿，平时也要多运动锻炼，说不定就会好。正常情况下如果结石比较小的话可以用药，在饮食上多注意，比如增大每天喝水量，多做一些跳跃方面的运动，小结石一般就随着尿排出去了。如果结石大概在10mm左右，建议先药物加日常习惯先观察。结石大于1cm建议尽快手术治疗。