结肠炎症性疾病原因有自身免疫反应、感染、遗传以及神经精神因素等多种因素。结肠肿瘤病变病因尚不明确，但相关高危因素逐渐被认识，过多的动物脂肪及动物蛋白饮食，缺乏新鲜蔬菜及纤维素食品，缺乏适度的体力劳动，遗传易感性在结肠癌的发病中也具有重要地位，如遗传性非息肉性结肠癌的错配修复基因突变，携带的家族成员，应视为结肠癌的一组高危人群。有些病如家族性肠息肉病已被公认为癌前病变。