子宫内膜异位症的检查首先需要做影像学检查，超声检查是诊断卵巢异位囊肿和膀胱，直肠内异症的重要方法，可确定异位囊肿位置，大小和形态；同时需要化验血清CA125和人附睾蛋白4，血清CA125水平可能升高，重症患者更为明显，但血清CA125不作为独立的诊断依据，主要用于监测病情的变化，评估疗效和预测复发。人附睾蛋白4在内异症多在正常范围，可用于与卵巢癌的鉴别；腹腔镜检查是诊断子宫内膜异位症的最佳方法。