女性更年期月经总不干净，应该尽快到医院就诊，行B超检查，了解子宫内膜情况，必要时行宫腔镜检查并诊刮，刮出组织送病理，以排除子宫内膜病变。如果刮宫后病理无异常，可以给予后半期应用孕激素，以达到保护子宫内膜的目的。因为在更年期由于排卵障碍，导致孕激素缺乏，而孕激素是保护子宫内膜的激素，如果缺乏了孕激素，子宫内膜长期在雌激素的刺激下，容易发生子宫内膜病变。