会的，水箱清洗剂都含有腐蚀成分，长时间肯定损伤水箱或管路的。汽车水箱清洗剂的作用：
1、比如采用食品级原料，对水箱机体和管道无任何危害，对集热管、内胆、贮水箱、镀膜真空管、密封胶圈、塑料件等部件无任何腐蚀；
2、绝色环保配方，清洗液可直接排放，强力高效，除垢效果显著，对人体也无任何伤害；
3、其可以将汽车水箱内的污垢有效地清除掉，内部沉淀的污垢由于长时间积累形成的，用清洗剂能够将其溶解，使水道畅通的。