龟头上长红疙瘩发痒发肿可能的原因是：一，患者有龟头炎，可以伴有包皮或者龟头等部位出现肿胀等等，需要进一步进行细菌学检查，抗感染治疗。二，存在有局部过敏，如接触过敏常见为接触避孕套过敏或者服用过敏药物，导致全身过敏，局部出现相关表现。全身其他部位出现类似红疙瘩，伴有瘙痒，需要进行过敏原检测，给予抗过敏治疗。三，患有性传播疾病，如患有梅毒或者尖锐湿疣等，都可以出现红疙瘩伴有瘙痒。若患有尖锐湿疣，则红疙瘩的体积逐渐增大，相互融合，并且体积增大压迫尿道口甚至影响排尿，需要进行局部切除。若检查确诊存在有梅毒，可以出现全身其他部位出现相应的皮疹改变，需要进一步进行抗梅毒治疗。