肝区疼痛一般表示肝脏本身的病变，以及肝区附近周围脏器的病变引起。肝脏本身的病变包括内科性和外科性的疾病，最常见的包括肝炎、肝硬化、脂肪肝、胆汁淤积、自身免疫性肝病等各种原因引起的内科性疾患，可以造成肝包膜张力增高、肝脏纤维化等改变，肝区产生疼痛。外科性疾病当中包括肝胆管结石、肝脏肿瘤，肝脏肿瘤有肝血管瘤、肝囊肿，如果增大到一定程度可以造成肝实质的压迫、肝脏被膜的紧张，肝恶性肿瘤可以造成肝脏局部坏死及肝脏的储备功能不足，均可以造成肝区疼痛。肝以外的病变包括局部的神经痛、软骨炎以及带状疱疹、软组织疼痛均可引起。