胃肠功能紊乱主要是由胃肠植物神经失调引起的，也可能是由长期的胃肠疾病引起的。如果确诊是胃肠功能紊乱，建议采用中西医结合的方式调节胃肠植物神经。如果出现腹胀、腹痛、反流、打嗝等症状，可以服用吗丁啉或者健胃消食片等辅助消化，促进胃肠的蠕动；也可以使用质子泵抑制剂，如奥美拉唑等，缓解反酸和打嗝的症状；还可以采用中药全面调理胃肠的功能。此外，乳酸杆菌乳糖酶等药物也可以调节菌群的失调，适用于菌群失调引起的消化不良。虽然药物能够调整胃肠道，但是长期使用药物会对身体产生一定的影响，平时患者一定要在日常的生活中注意饮食的调整。