胃肠炎肚子疼在治疗时除了对症给予抗感染治疗和预防脱水治疗外，还可以参考中医腹泻病来治疗。若患者总是自觉隐隐腹痛，热敷后腹痛可缓解，伴有食欲低下，精神不济，大便次数增多且不成形，则考虑是脾胃虚寒所致，治疗时宜选用温中散寒止痛的中药，可咨询中医师后选用小建中汤，香砂养胃丸等来治疗。若患者每每在黎明前后腹痛发作，大便稀薄不成形，大便后腹痛可以缓解，则多是由于肾阳虚衰所致的五更泻，治疗时应温补脾肾，固涩止泻，可以在医师指导下选用四神丸来治疗。