肺结核的确诊主要依赖于胸部影像学检查，痰涂片镜检和结核菌培养，有时要进行纤维支气管镜检查。胸部影像学检查对肺结核的确诊有重要意义，尤其是肺CT检查，有助于发现隐蔽区的病灶和孤立性结节的鉴别诊断，可以显示纵隔肺门淋巴结，肺内空洞，钙化，支气管充气征和支气管扩张等，较x线更为敏感。痰涂片镜检和结核菌培养是确诊肺结核最特异性的方法，在我国非典型分枝杆菌尚属少见，抗酸杆菌阳性肺结核病诊断即可成立，当患者仍然无法确诊时，经支气管镜对支气管或肺内病灶钳取活检做病原学检查，有助于诊断和鉴别诊断。