尿中上皮细胞升高取决于升高的上皮细胞种类，尿中的上皮细胞来自肾至尿道的整个泌尿系统，包括肾小管上皮细胞、移行上皮细胞和复层扁平上皮细胞，肾小管上皮细胞来源于远曲和近曲小管，如在尿中出现常提示肾小管病变，观察尿中肾小管上皮细胞对肾移植术后有无排斥反应也有一定的意义。移行上皮细胞可分为表层移行上皮细胞，主要来源于膀胱，中层移行上皮细胞主要来源于肾盂，底层移行上皮细胞来自输尿管、膀胱和尿道。正常尿中无或者偶见移行上皮细胞。在输尿管、膀胱、尿道有炎症时可大量出现，应警惕移行上皮细胞癌。复层扁平上皮细胞也称为鳞状上皮细胞，来自尿道前段，女性尿道有时会有来自阴道的复层扁平上皮细胞，尿中大量出现或片状脱落，且伴有白细胞、脓细胞，见于尿道炎。