早上咳嗽有痰原因是呼吸道炎症，由于机体的抵抗力下等原因降引起体内受到病毒、细菌入侵导致的炎症反应。下半夜的时候，人体的交感神经相对比白天兴奋，容易导致体内腺体分泌旺盛，使呼吸道内的分泌物相对增多。所以，在早晨的时候，就会将积聚一晚上的分泌物，以咳嗽的方式和痰的形式，排出体外，常见于支气管炎、肺炎等。