公务员医疗补助不算社会保险，是国家公务员在参加城镇职工基本医疗保险制度的基础上国家对公务员实行的医疗补助。医疗补助经费来源于同级财政，实行专款专用、单独建账、单独管理，与基本医疗保险基金分开核算。