功能性肠病最主要的临床表现是腹痛、排便习惯和粪便性状的改变。几乎所有肠易激综合征患者，都有不同程度的腹痛，部位不固定，以下腹部和左下腹多见，排便之后腹痛可缓解，极少有睡眠中痛醒的患者；腹泻呈糊状或者稀水样，一般每日3到5次，严重的可达10几次；也可表现为腹泻与便秘交替发生。功能性肠病，又称为肠易激综合征，以腹痛伴排便习惯改变为特征，而无器质性病变的常见的功能性肠病。起病隐匿，症状反复的发作或者慢性的迁延，病程可长达数年至数10年，但全身健康状况不受影响。精神、饮食等因素，常常诱使症状复发或者加重。