如果肛瘘手术后出现发热，应当积极的查看伤口，分析原因，然后对症治疗，常见的有以下情况：一，肛瘘手术后，如果创面继发感染形成脓肿，会引起发烧，出现这种情况，应当及时的扩大创面，将脓液充分引流，术后积极的给予中药熏洗或者坐浴，保持引流通畅，可以应用五倍子汤、苦参汤或止痛如神汤治疗。二，肛瘘手术后如果患者没有注意饮食调理，食用一些不洁净的食品，容易导致急性胃肠炎，导致排大便次数增多，也会引起感染性的发热，出现这种情况，应当积极的对症治疗，注意饮食调理。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。