引起患者小便有异味的主要原因如下：一，与饮食习惯有关，患者近期吃了高蛋白、高脂肪饮食或者吃大蒜等等食物，有可能会导致患者小便有异味。二，感染，也就是尿道口、生殖器不干净，有致病菌感染，也会出现小便有异味。三，小便放的时间比较久，存留时间比较长，也会出现小便有异味，可以通过多饮水，勤排尿，尿液异味就会消失，不用过度紧张，也不需要特殊处理。如果小便有异味持续存在，往往需要到医院行进一步的检查，包括尿常规、泌尿系彩超、CT甚至尿道膀胱镜等方面检查来做出明确诊断。