卵巢脓肿是由于盆腔感染了一些外源性病原体和内源性的病原体，而引起的一种急性化脓性炎症。这些病原体常见的有沙眼衣原体，淋病奈瑟菌，部分需氧菌及厌氧菌。卵巢本身很少发生炎症，因为它的表面有一层白膜，这层白膜是卵巢的良好屏障，可以防止卵巢受到侵害。大部分的卵巢脓肿是由于输卵管炎症导致，输卵管炎症会和卵巢发生粘连，发生卵巢周围炎，炎症通过卵巢排卵时的破孔侵入到卵巢内部，从而形成卵巢脓肿。