肾囊肿化脓以后单纯的药物很难控制感染，而且肾脏又是一个血运比较丰富的脏器，是特别容易出现血行播散，引起全身炎症症状的，所以肾囊肿化脓以后药物也不能够很好的，很快的进入到囊腔。所以对于局部的感染比较难以控制，出现了肾囊肿的话能需要考虑穿刺引流囊液，把脓液引出以后，在这个基础上再给予积极的抗生素治疗，会达到比较好的治疗效果，如果反反复复的出现了囊肿的感染是需要考虑外科手术给予囊肿剥离的。