耳根后边阵痛考虑局部皮肤创伤会造成疼痛。另外，患者出现局部神经痛以后也会表现为耳根后面一阵一阵疼痛。部分患者由于免疫力下降出现局部带状疱疹感染诱发耳根后边一阵阵疼痛，如果局部出现脓肿也会导致耳后出现疼痛等不适症状。