十二指肠球炎的治疗主要以药物治疗为主。药物治疗主要包括以下几种药物：1.质子泵抑制剂或H2受体阻断剂。比如奥美拉唑、西咪替丁等药物，可以缓解疼痛，促进溃疡面愈合。2.根治幽门螺杆菌的药物，比如克拉霉素、甲硝唑、阿莫西林等。3.胃黏膜保护剂。常用的有硫糖铝、铝碳酸镁或胶体果胶铋等药物，有效促进溃疡面的愈合。十二指肠球炎经过有效的治疗后，一般预后良好。