生殖器上长水泡，主要考虑是生殖器疱疹。生殖器疱疹是由于生殖器疱疹病毒二型感染导致的，主要导致阴茎、会阴部、肛周等生殖器周围长一些透亮的水泡，这些水泡可以慢慢融合成大水泡，水泡沿着神经支配的部位分布，局部会有灼热、麻木的感觉。生殖器疱疹经过积极抗病毒治疗，一般能够恢复，但是容易反复发作，所以要注意增强身体的抵抗力，预防复发，平时要注意局部卫生，要保持阴部的清洁、干燥，要穿宽松透气的内裤。