拉肚子低烧的治疗根据不同的疾病有不同的治疗方法。比如肠炎、肠道真菌感染、肠结核、溃疡性结肠炎、结肠息肉、肠癌等疾病。如果是肠炎需要抗感染治疗。如果是肠道真菌感染需要抗真菌治疗。如果是肠结核，需要规律、足量的抗结核治疗。如果是结肠息肉，需要切除肠道息肉等对症治疗。如果是肠癌，需要手术切除或者放化疗等治疗。除此之外需要给予退烧药物治疗，如果是低烧，多饮食；如果是中烧，口服退烧药物；如果是高烧，给予静脉药物降温治疗。另外口服一些调节肠道菌群的药物，比如醋酸梭菌胶囊。