阴茎口疼痛的主要原因是由于阴茎或者是尿道外口，受到各种炎症、理化因素刺激所引起，常见的有以下几种情况：第一、感染性疾病，感染性炎症刺激是引起阴茎口疼痛最常见的原因，包括阴茎头、尿道或者邻近器官的感染，比如阴茎头炎和尿道炎等疾病。第二、泌尿系统的结石，比如尿道外口的结石，由于结石刺激尿道黏膜，从而引起阴茎口疼痛的症状。第三、化学或者是其他因素的刺激，比如机体在脱水的时候尿液浓缩，尿液中的化学成分刺激尿道外口的黏膜，会引起阴茎口疼痛的症状。另外，尿道内的异物、某些药物等，也会引起这种症状。