支原体感染咳嗽，通常起病缓慢，潜伏期比较长，一般为2到3周，并且会出现全身不适、乏力、头痛，2到3天后会出现发热，体温最高达39摄氏度左右，伴有咽痛和肌肉酸痛等症状。咳嗽是支原体感染的突出症状，一般于病后2至3天开始，起初为干咳，后逐渐转变为顽固性的剧烈咳嗽，常有黏液痰，偶尔还会有血丝痰，少数病例可类似百日咳，咳嗽可持续1到4周。肺部体征不是很明显，甚至没有，少数患者可以听到干湿啰音，但多会消失。剧烈的咳嗽及发热的临床表现不一致，这种情况为本病的主要特点之一。