哺乳期尿道疼痛小便刺痛的原因有：1.女性在哺乳期的时候，体质相对较弱、机体免疫力低下，如果不注意会阴部卫生或者饮水量比较少，就可能导致泌尿系感染，可能会出现尿道疼痛、小便刺痛的症状。应该多喝开水、勤排尿，保持会阴部清洁，如果症状不见好转，可以去医院做尿常规检查、血常规检查，必要的时候可以做尿细菌培养，明确诊断后，可以给予头孢类抗生素进行治疗。2.如果女性得了淋菌性阴道炎也可能会出现尿道口疼痛、瘙痒、小便刺痛的症状。如果诊断明确也可以给予头孢类抗生素进行治疗。3.哺乳期女性如果得了霉菌性阴道炎，也可能会出现外阴部灼热痛、尿道疼痛或者排尿刺痛，可以给予克霉唑栓阴道上药进行治疗。