男性滴虫性阴道炎多发生于与女性患者近期内有过性接触的男性，约70%可从尿道中分离出滴虫。有症状的患者主要表现为尿道黏液性分泌物增加，尿道或尿道口出现刺痒、疼痛、烧灼感，还可以出现尿频、尿急、尿痛等排尿困难。部分患者可表现为龟头炎的症状，导致龟头处红肿，表面可以见到糜烂、渗出，伴有瘙痒感，极少数可导致前列腺炎、附睾炎以及不育。