直肠肿瘤的形成原因相对复杂，可能是由环境、饮食以及生活习惯和遗传因素等协同作用的结果。直肠肿瘤发病与饮食因素密切相关，其中包括低纤维饮食、高脂高蛋白饮食、缺乏微量元素与维生素，其中包括缺乏钙、硒、钼、抗氧化维生素A、C、E和β-胡萝卜素。遗传因素在直肠肿瘤发病中也起着重要作用，有直肠肿瘤家族史者，直系亲属患直肠肿瘤的风险较无家族史者高。年龄大于50岁，长期的精神抑郁也是直肠肿瘤的危险因素。如果患者经常进食腌制、熏制、富含硝酸盐和亚硝酸盐的食物也会增加直肠肿瘤的发病。如果患者有溃疡性结肠炎，克罗恩病也会增加直肠肿瘤的发病率，如果长期不运动、便秘、患有血吸虫病等，也会增加直肠肿瘤的发病。