在临床上，对于患有肛瘘的患者，其治疗原则需根据肛瘘的解剖结构以及内口瘘管的位置来选择不同的治疗方法。但是，主要是手术切除以及挂线疗法或者是药物治疗改善症状。其中，手术时要找到原发的内口，并把感染的肛窦、肛门腺及其导管切除干净，这是肛瘘治疗的关键。处理好瘘管及支管、死腔，要把瘘管的管道支管，死腔等清洗干净，以免术后复发。肛瘘手术时应明确诊断，查明内口及瘘管走向，保留肛管直肠环，以维持正常的肛门括约功能。总之，在具体手术操作中，一定要仔细寻找到内口，并防止切断肛管直肠环，患者要记住肛瘘不能自愈，必须进行手术治疗。