男性小便时尿道刺痛常见的疾病以及治疗办法如下：第一，膀胱炎，膀胱炎患者由于炎症刺激膀胱黏膜，会出现尿频，尿急，尿痛患者在解小便的时候，会阴部或者尿道有刺痛感，或者是烧灼感，这种情况，一般需要完善尿常规等方面的检查，如果确诊后，需要使用抗生素治疗，常见的有头孢类，喹诺酮类，比如头孢克肟，左氧氟沙星。在治疗期间还要多喝水，饮食要清淡。第二，尿道炎，尿道炎一般是由淋病奈瑟菌，支原体，衣原体感染所引起，患者会表现为尿道刺痛，而且尿道还会有瘙痒不适。尿道口会有脓性分泌物流出。治疗上一般可以取尿道口分泌物做培养，根据培养的结果，选择相应的抗生素治疗，同时也要多喝水。