强直性脊柱炎的确切病因目前尚不清楚，据说与基因改变有关。拥有HLA-B27基因的人，患病风险会增加，但只有一部分带有这种基因的人会患上这种疾病，很多有这种基因的人从来不会患上强直性脊柱炎，所以关系并不密切。其他可能影响强直性脊柱炎的因素包括:遗传，这种疾病有家族遗传的倾向，如果父母或兄弟姐妹患有强直性脊柱炎，患此病的可能性是没有家族病史者的10到20倍；性别，男性比女性更容易患强直性脊柱炎；年龄，发病通常发生在青春期晚期或成年早期。