细菌性睾丸炎的治疗有一般治疗，如卧床休息，托起阴囊，早期可用冰袋冷敷，避免性生活，后期可热敷，但应告知患者，可能会影响睾丸的生精功能，主要的治疗是抗菌素的使用，在使用抗菌素治疗前应当行相关的细菌学检查，经验性的推荐使用头孢类抗生素点滴加大环内酯类和喹诺酮类抗生素口服，以后根据培养结果选择敏感抗生素，通常静脉给药1~2周后再口服药物2~4周，对衣原体感染的患者可选择大环内酯类或喹诺酮类抗生素口服，疗程2~4周，性伴侣应同时检查治疗，止痛药物可选择口服镇痛药物或1%利多卡因精索封闭，缓解疼痛，抗炎药物可使用非甾体类抗炎药物，中药治疗可以改善微循环，减少附睾纤维组织生成，缩短病程，对化脓性的附睾睾丸炎脓肿形成者，选择脓肿切开引流。少数出现睾丸坏死者要行睾丸切除术，但应慎重选择。