亚甲炎是自限性疾病。患者如果只是上呼吸道感染的症状，比如疲乏无力、肌肉酸痛、体温升高，或者患者甲状腺区的疼痛可以忍受。这时不需要用任何药物，等待自然病程结束，一般过程在两周左右。如果患者疼痛特别明显且不能耐受，也可以给予镇痛或者非甾体类抗炎药的治疗。如果疼痛更加剧烈或者有甲状腺明显肿胀的症状，也可以给予糖皮质激素的治疗厄，比如泼尼松20-40mg/d，分次服用。一般在症状完全缓解以后的1-2周可以逐渐减量，总疗程在6-8周左右。但是需要注意的是，激素的减量不要过快，如果过早的停药可以导致病情的反复。