射精后疼痛最常见于慢性前列腺炎病人，病人发生慢性前列腺炎时会导致精液发生感染，会导致致病菌沿输精管走行区出现感染症状，病人在射精后会将感染性致病微生物射入后尿道，引起后尿道黏膜红肿、糜烂，会出现后尿道疼痛症状，病人会出现射精后疼痛症状。病人出现上述症状时，需及时到男科或泌尿外科就医，通过精液细菌培养，通过精液支原体、衣原体培养，常常能找到致病微生物。通过选择有效的抗生素，如磷霉素氨丁三醇散、盐酸米诺环素胶囊、克林霉素分散片等药物序贯治疗四周左右，多数男性射精后疼痛症状会明显好转。