中医治疗肛瘘，一般以手术治疗为主，内治法多用于手术前后，以增强体质，减轻症状，控制炎症发展，辨证论治的内治法如下：一、湿热下注：清热利湿，二妙丸合萆薢渗湿丸加减。二、正虚邪恋：托里透毒，托里消毒散。三、阴液亏损：养阴清热，青蒿鳖甲汤。其他疗法如手术挂线法等等。内痔辨证论治如下：一、风热肠燥：清热凉血祛风，凉血地黄汤。二、湿热下注：清热利湿止血，脏连丸。三、气滞血瘀：清热利湿，行气活血，止痛如神汤。四、脾虚气陷：补中益气，升阳举陷，补中益气汤加减。外治法：可用各种药物煮沸熏洗，可以用五倍子汤、苦参汤等等，具有活血止痛，收敛消肿的作用，其它有外敷法、塞药法、枯痔法以及插药疗法等等。外痔的辨治：内治法主要是湿热下注证，清热利湿，活血散瘀，萆薢化毒汤合活血散瘀汤加减；外治法主要是肿胀、疼痛者，可用苦参汤加减熏洗，外敷黄连膏。