针对肾结石的病人，如果合并了肾囊肿，具体治疗还是要根据具体肾结石的情况和囊肿的情况来决定。如果病情主要是以肾结石为主，那可能就优先治疗肾结石，而如果病情主要以囊肿为主，囊肿体积比较大，那可能优先处理肾囊肿。因为肾结石如果体积比较小的话，没有形成梗阻或者梗阻，比较轻微的时候可以通过一些保守的方法来进行治疗，就可以取得比较好的效果。而如果结石梗阻比较严重，那可能就需要进行积极的手术治疗。对于肾囊肿来说，如果囊肿体积比较小，直径小于四个厘米，一般是保守治疗就可以，如果囊肿体积大于四个厘米，那可能就需要进行手术治疗。