判断自然流产流干净了，首先在孕囊排出后，要看孕囊是否完整，其次要观察阴道出血情况，如果阴道出血不多，可以观察。一般情况下，阴道出血在七天左右停止，考虑是自然流产流干净了。如果孕囊排出后，有阴道出血量多，明显大于月经量，要及时去医院就诊，考虑有宫腔残留。如果孕囊排出后，一直有淋漓不尽的出血大于十天，也要去医院做B超检查，看是否有宫腔残留。如果有宫腔残留，建议清宫治疗，阴道出血多，出血时间长，有可能会引起贫血，宫腔感染，继发不孕等情况。