吃辣椒上厕所肛门疼，主要就是用药物进行对症的治疗。首先，使用温水或者是温盐水对肛门的局部做简单的清洗，然后使用软巾或者是软毛巾将水分蘸干。如果疼痛不缓解的，可以适当的使用止疼的药栓肛管直肠内塞入，在临床上比较常用的就是吲哚美辛栓，还可以使用一些止疼的胶浆做肛门局部的涂抹，比较常用的有利多卡因胶浆，都可以起到良好的缓解疼痛的作用。另外，在肛门的局部也建议垫些柔软的纸巾，对于疼痛也具有良好的缓解效果。由于辛辣刺激性的食物，尤其是辣椒当中的辣椒素不被身体所吸收，可以刺激肛管直肠位置的皮肤和黏膜组织，出现灼烧样的疼痛。患者在平时尽量的减少辛辣刺激性的食物。