胆管细胞癌晚期的治疗方法有手术切除、放化疗、肝移植。手术治疗还是胆管细胞癌的首选治疗方法，如果没有手术禁忌证，建议尽早进行手术治疗。根据胆管病变部位，切除相应的肝脏。术后根据患者的具体情况和病理学类型，选择是否进行术后辅助治疗。如果患者已经失去了手术的机会，可以选择化学治疗。如果患者出现胆管梗阻、黄疸，可以进行ERCP治疗，经内镜胰胆管造影置入带放射性粒子的支架，不仅可以解决胆管梗阻问题，还可以对病变部位进行放射治疗。肝移植手术，也是晚期肝胆管细胞癌的治疗方法之一。