肛瘘手术后应当保持大便通畅，防止粪便刺激肛瘘手术后的创面，引起疼痛、出血等并发症。肛瘘手术后可以适当的口服蜂蜜或液状石蜡油，软化大便，润滑肠道，促进大便的顺利排出。术后患者应当避免久蹲久坐，排大便时不能够前往厕所蹲位解大便，防止加重粪便对创面的刺激。肛瘘手术后还应当积极的给予止疼药物治疗，防止出现创面疼痛，导致患者恐惧排便，从而引起习惯性便秘。肛瘘手术后还应当加强营养支持治疗，促进肉芽组织生长，促进创面的愈合。