跑步后膝盖疼的话，可以采用以下治疗方法：首先注意要多休息为主，膝部可以用热水热敷，或者是暖水袋及热宝热敷。避免高强度活动。必要时可以吃消炎镇痛药物即保护软骨药物，如盐酸氨基葡萄糖片治疗。