结肠炎有一般感染性的炎性改变，还有一些非特异性的炎症改变。急性感染性结肠炎因为剧烈的呕吐和腹泻，会引起水、电解质紊乱，出现休克等严重后果，而像溃疡性结肠炎、克罗恩病等炎症性肠病还会出现溃疡性的穿孔、出血、肠梗阻。如果炎症波及结肠壁的肌层，还会引起结肠的节段性麻痹，出现中毒性结肠扩张的后果。因慢性病程可伴有营养不良等、还有肠外表现、慢性非特异性炎症的迁延不愈反复发作、以及病变范围比较广泛的还有发生癌变的风险。