目前在临床上，对于肛窦炎的治疗方法，主要是选择药物保守治疗，因为肛窦炎主要是肛隐窝感染发炎，排便的时候粪便阻塞了肛窦内，导致肝腺内分泌物不能排出，进而诱发的肛窦炎。这种情况下，首先要保持大便通畅，避免出现经常性的腹泻或者是便秘。同时可以配合甲硝唑注射液保留灌肠，然后配合普济痔疮栓或者是双氯芬酸钠栓内塞，进而改善局部不适。再配合口服抗生素，比如头孢或者是阿莫西林等药物进行治疗，一般可以很好的治愈肛窦炎。同时饮食方面也要注意忌口，辛辣刺激燥热的食物要尽量的避免。但是如果肛窦炎感染进一步加重，导致局部出现肛周脓肿，那么则建议尽早的采取肛窦切开引流术，或者是肛周脓肿一次性根治术治疗。