指甲凹凸不平怎么治疗可以根据患者的具体情况来入手。缺铁性贫血导致的指甲凹陷需要增加含铁剂食物的摄入，补充叶酸和维生素B12。由于缺钙引起的，可以口服钙尔奇或者葡萄糖酸钙口服液，也可以补充钙片，要多晒太阳，多吃含钙的食物，促进钙的合成。如果患者是儿童，出现指甲凹凸不平的现象时，可以在医生的指导下补充维生素以及微量元素来缓解症状。指甲凹陷还可能与以下疾病有关，如雷诺病、心脏病、甲状腺功能减退症、真菌感染、指甲外伤、肌肉和骨骼疾病等，治疗原发疾病后可改善指甲状况。