脑囊虫病的治疗主要依靠药物驱虫治疗、外科手术治疗。1.药物驱虫治疗药物驱虫治疗适用于囊虫活动期，常用驱虫药物有吡喹酮、阿苯达唑等。2.手术治疗适用于驱虫治疗无效或不宜行药物驱虫治疗的病人。常用术式及适应证如下：3.颞肌下减压术：适用于弥漫性脑实质囊虫，伴严重脑水肿和高颅压，经驱虫、脱水、激素治疗后仍存在颅内高压甚至危及生命者。4.脑室-腹腔分流术：适用于蛛网膜下腔型或脑室型合并脑积水、颅内高压者。但是，如果伴发蛛网膜炎，脑脊液蛋白明显升高，分流术容易失败。5.囊虫摘除术：适用于脑实质单发或多发巨大囊虫、脑室内或蛛网膜下腔囊虫。囊虫摘除术前后仍需药物治疗。6.其他控制高颅压，常规应用甘露醇和皮质激素以减轻脑水肿。应用抗癫痫药物如卡马西平等。